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| Vorbemerkungen |
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Definitionen, Schreibweisen
Anforderungen an die
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Begriffe |
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Informatik |
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Informationstheorie |
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Informatik |
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Grundlagen, Algorithmen,
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Übungen zum Umgang mit Netzwerken
Übungen zum Betriebssystem Unix |
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Neuronale Netze ,
Übungen |
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Genetische Algorithmen
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Statistische
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Biologie
und Grundlagen |
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Einführende
Simulation
Sequenzen Sequenzdatenbanken, Übungen |
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Proteine:
Sekundärstruktur
, 3D-Strukturen, Domänen, Übungen |
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Algorithmen
auf Sequenzen |
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Codon Usage
Dotplots, Übungen
Distanzen und Alignments, Übungen
Scoring-Matrizen, Übungen
Statistik von Scores, Komplexität von Sequenzen
,
FASTA und BLAST, Übungen
Multiples Alignment ,
Übungen
Phylogenetische Bäume ,
Jenseits von FAST und BLAST ,
Übungen |
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Algorithmen
auf 2D-Strukturen |
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Vorhersage der
RNA-Sekundärstruktur , Übungen |
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Vorhersage der
Protein-Sekundärstruktur ,
Übungen |
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Algorithmen
auf 3D-Strukturen |
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Threading , Kraftfelder
,
3D-PSSM ,
Übungen
Vergleich von 3D-Strukturen |
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Empfehlungen
für die Anwendung |
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Zur Bewertung statistisch nicht
signifikanter Treffer
Eine Strategie zur Bestimmung
homologer Proteine
Checkliste für den Umgang mit
Motiven und Profilen |
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Genomics |
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Von der DNA zum annotierten Genom ,
Übungen
Erwartungswert für die Anzahl von
Contigs bei Shotgun Sequenzierung
Beschreibung des CELERA-Assemblers
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Curriculum Molecular Biology |
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Introduction, Sequences,
Sequence Databases |
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Dotplots, Sequence Alignments,
Scoring Matrices |
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Heuristic Methods:
BLAST |
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Multiple Sequence
Alignment |
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Questions |
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Lecture_1,Lecture_2,
GP, VLIN |
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Weiteres
Material zur Bioinformatik |
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Homepage von Prof. Waack,
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Zitierte Literatur |
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Zusammenstellung der
Übungen |
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Zusammenstellung wichtiger
Tools
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Informationstage
2001, BISS2001 |
